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Documentation Espace de travail Wiki

Wiki

La documentation d'équipe d'un espace de travail : arborescence de pages, modèles, recherche et pages vérifiées.

En résumé

Le wiki est la documentation de l’équipe, rangée en arborescence de pages écrites en Markdown. Il sert à consigner ce qui ne tient ni dans le code ni dans les données : conventions, protocoles, dictionnaires de variables, comptes rendus. Des modèles évitent la page blanche, et une page peut être marquée vérifiée pour distinguer ce qui fait foi.

Client Disponible en mode client-only — tout fonctionne dans le navigateur, sans backend. Backend Disponible avec le backend FastAPI.

À quoi sert un wiki dans Linkr

Un entrepôt de données s’accompagne toujours d’un savoir qui ne s’y trouve pas. Pourquoi telle variable est inexploitable avant 2019. Comment le service définit une réadmission. Quelle procédure suivre avant de publier.

Ce savoir circule d’ordinaire par oral, par courriel, ou dans un document que personne ne retrouve. Le wiki lui donne un endroit, à côté des données qu’il décrit plutôt que dans un outil séparé.

L’arborescence

Les pages s’organisent en arbre : une page peut contenir des sous-pages, qui peuvent elles-mêmes en contenir. C’est ce qui permet de garder un wiki lisible quand il grandit — un chapitre par grand sujet, le détail en dessous.

Chaque page reçoit une icône, qui aide à repérer d’un coup d’œil la nature d’une section dans l’arbre. Un clic droit sur une page propose Nouvelle sous-page, Renommer, Changer l’icône et Supprimer la page.

demo.linkr.interhop.org
Pages
Conventions
Dictionnaire des variables
Biologie
Constantes
Procédures
Demande d'extraction
Réunions
Dictionnaire des variables
Pièces jointesModifier

Dictionnaire des variables

Mis à jour il y a 3 jours

Une ligne par variable exploitée dans les études du service.

VariableTable sourceUnitéRemarque
Lactatemeasurementmmol/LFiable depuis 2019
FiO₂measurement%Saisie horaire
Noradrénalinedrug_exposureµg/kg/min—

Note

Toute nouvelle variable passe par une revue avant d'être ajoutée ici.

Le wiki : l'arbre des pages à gauche, la page ouverte à droite, avec son fil d'Ariane et sa date de mise à jour. Cliquez sur Vérifier pour marquer la page, et sur le chevron pour replier une branche.

Chercher plutôt que naviguer

Au-delà de quelques dizaines de pages, on ne parcourt plus l’arbre : on cherche. Ctrl + K ouvre la recherche depuis n’importe où dans le wiki.

Les modèles

La fenêtre Nouvelle page propose un modèle, qui pose d’emblée une structure adaptée au type de document :

  • Procédure (SOP) — une marche à suivre, étape par étape.
  • Dictionnaire de données — la description des variables d’une source.
  • Onboarding — ce qu’un nouvel arrivant doit lire en premier.
  • Notes de réunion, FAQ, Protocole d’étude, Article — ou une page vide si rien ne convient.
demo.linkr.interhop.org

Nouvelle page

Titre de la page*
ex. Guide d'accueil
Modèle
Squelette de la page
  • ##Purpose
  • ##Scope
  • ##Responsibilities
  • ##Procedure
  • ##Revision history
La fenêtre Nouvelle page et ses huit modèles. Cliquez sur un modèle pour voir le squelette de titres qu'il pose — en anglais, comme dans l'application.

L’intérêt n’est pas de gagner quelques minutes de mise en forme, mais d’obtenir des documents comparables : deux procédures écrites à six mois d’intervalle se ressemblent, donc se lisent plus vite.

Écrire une page

Modifier ouvre l’éditeur : le Markdown à gauche, le rendu à droite. Au-delà du texte courant, la barre d’outils insère quelques blocs utiles :

  • des encadrés — note, conseil, avertissement — et des blocs repliables pour ranger un détail sans l’effacer ;
  • une table des matières générée à partir des titres ([[toc]]) ;
  • un lien vers une autre page du wiki par son nom ([[Nom de la page]]) ;
  • des diagrammes Mermaid — organigramme, séquence, Gantt.

Les pièces jointes — une image, un PDF — s’ajoutent depuis le bouton du même nom, en haut de la page.

Chaque page affiche la date de sa dernière mise à jour — souvent la première chose à regarder avant de faire confiance à une documentation.

Les pages vérifiées

Une page de wiki vieillit. Celui qui la lit ne sait pas toujours si elle décrit encore la réalité.

Une page peut donc être marquée vérifiée — bouton Vérifier, en haut de la page : quelqu’un l’a relue et en confirme le contenu. C’est une distinction utile entre une note écrite au fil de l’eau et une page qui fait référence.

Un usage typique

Le dictionnaire des variables de l’entrepôt est marqué vérifié après chaque revue annuelle. Les notes de réunion, elles, ne le sont jamais — elles datent leur propre contenu.

Pour aller plus loin

  • Vue d’ensemble — ce que l’espace de travail regroupe autour du wiki.
  • Catalogue de données — pour documenter les variables elles-mêmes, plutôt que les procédures.
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