En résumé
Une cohorte délimite une population : les patients de plus de 65 ans hospitalisés pour sepsis en 2023. Elle se construit par critères combinés en ET, en OU et en NON, sans écrire de SQL. Exécuter en donne l’effectif et l’attrition ; Alimenter fige la liste des membres, que lit la page Données individuelles.
Définir qui entre dans l’étude
C’est la première étape concrète de la plupart des projets, et celle qui engage le plus : les critères d’inclusion déterminent ce que vaudra tout ce qui suit.
Dans Linkr, une cohorte n’est pas une liste d’identifiants collée depuis un tableur. C’est une définition — un ensemble de critères — que l’on peut relire, discuter, corriger et rejouer. Ce qui change tout au moment de publier : vous transmettez le raisonnement, pas seulement son résultat.
Dans ce guide
Une cohorte se crée depuis la page Cohortes du projet, puis se travaille en deux temps, qui alternent jusqu’à ce que la définition tienne : on pose les critères, on exécute, on lit le résultat, on corrige.
Construire une cohorte
L’écran du constructeur, le niveau d’une ligne, les neuf types de critère et leurs formulaires, la combinaison en ET, OU et NON, la version figée et l’échange avec OHDSI ATLAS.
Résultats, SQL et rapport
Exécuter, lire l’effectif et l’attrition, relire les patients et les tables filtrées, modifier la requête SQL, et produire le rapport de cohorte.
Ce qu’une cohorte alimente
À connaître pour ne pas la chercher là où elle n’agit pas.
Une cohorte filtre la liste des patients de la page Données individuelles : vous sélectionnez la cohorte, et vous ne parcourez plus que ses membres. Le constructeur a aussi son propre onglet Patients, pour relire les membres d’un résultat sans quitter la cohorte — voir Résultats, SQL et rapport.
Une cohorte ne filtre pas encore les jeux de données ni les tableaux de bord
C’est la limite à connaître. Pour travailler sur les données de votre cohorte en dehors de la page Données individuelles, exportez les résultats en CSV, ou reprenez son SQL dans une collection de scripts.
La cohorte apparaît aussi comme un nœud du pipeline, mais celui-ci est un schéma sans exécution : ce nœud documente l’enchaînement, il ne filtre rien.
Des cohortes au niveau d'une base
Une base de données a aussi ses propres cohortes — l’onglet Cohortes de la base, hors de tout projet. Elles ont le même constructeur, sans Alimenter, mais avec Dériver en mode serveur : une nouvelle base limitée aux membres de la cohorte. Voir Sous-bases dérivées.
Pour aller plus loin
- Construire une cohorte — le niveau, les critères, leur combinaison, la version figée et ATLAS.
- Résultats, SQL et rapport — exécuter, lire l’attrition, modifier le SQL, produire le rapport.
- Données individuelles — vérifier sur pièces que la cohorte contient les bons patients.
- Sous-bases dérivées — tirer une nouvelle base des membres d’une cohorte.
- Concevoir une étude — écrire des critères d’inclusion défendables.