En résumé
Un catalogue de données décrit ce que contient une base — quels concepts, sur quelles périodes, dans quels services, pour combien de patients — sans jamais publier de donnée individuelle. On choisit des variables et les croisements à compter, Linkr calcule, anonymise, puis produit une page HTML autonome accompagnée de métadonnées Health-DCAT-AP, à télécharger ou à déployer sur GitLab ou GitHub Pages.
Deux « catalogues » à ne pas confondre
Le catalogue de données, décrit ici, répond à : « que contient cet entrepôt ? ». Il décrit vos données pour que d’autres équipes sachent si elles valent la peine d’être demandées.
Le catalogue communautaire répond à une tout autre question : « quels schémas, plugins ou projets puis-je installer ? ». Il indexe des entités Linkr publiées, pas des données.
Le problème : annoncer sans exposer
Un entrepôt hospitalier est invisible de l’extérieur. Une équipe qui cherche une cohorte de patients septiques ne peut pas savoir si vous en avez, ni combien, ni sur quelles années — sauf à demander, attendre, et souvent découvrir que la réponse était non.
Publier les données est hors de question. Mais publier leur description — les concepts présents, leur volumétrie, leur répartition dans le temps et entre services — ne présente pas le même risque, à condition que les comptages soient trop grossiers pour réidentifier qui que ce soit.
C’est ce que produit un catalogue : un inventaire chiffré, anonymisé, publiable. Il donne des ordres de grandeur ; pour des effectifs exacts sur une question précise, on passe par une étude de faisabilité, avec les cohortes.
Dans ce guide
Un catalogue se crée depuis la page Catalogue de données de l’entrepôt, avec Nouveau catalogue, puis se règle onglet par onglet : on configure et on calcule, on anonymise, on décrit, puis on publie. La première page suit ce parcours de bout en bout ; l’anonymisation, qui se règle entre le calcul et la publication, a sa propre page parce qu’elle demande qu’on s’y arrête :
Construire et publier un catalogue
La base décrite, les variables et les croisements à compter, le calcul, les métadonnées Health-DCAT-AP, puis l’export ou le déploiement sur GitLab / GitHub Pages.
Anonymiser un catalogue
Le seuil, le masquage secondaire, la perturbation des effectifs et l’audit de divulgation — à régler après le calcul, avant de publier.
La page publiée
La page s’organise en quatre onglets :
- Explorer — choisissez une, deux ou trois variables dans le panneau latéral et filtrez chacune d’elles : graphiques, chiffres clés et tableau suivent.
- Métadonnées — la description Health-DCAT-AP du jeu de données, et le JSON-LD.
- Schéma — la structure de l’entrepôt source, en tables et en diagramme.
- Infos — comment les effectifs ont été calculés et protégés.
Entrepôt de réanimation
Catalogue de concepts
Séjours de réanimation adulte depuis 2021 : patients, séjours, biologie, signes vitaux et médicaments.
| Période ╲ Genre | Homme | Femme | Inconnu |
|---|---|---|---|
| 2021 | 2 310 | 2 015 | < 10 |
| 2022 | 2 402 | 2 120 | 14 |
| 2023 | 2 451 | 2 188 | masqué |
| 2024 | 2 498 | 2 231 | 11 |
Sous des filtres, les chiffres clés additionnent les cellules concernées quand elles s’additionnent. Quand ce n’est qu’une approximation — un patient présent sur deux périodes compte dans chacune, les cellules masquées sont écartées, les effectifs sont perturbés — le chiffre est précédé de ≤, ≥ ou ≈, et l’icône d’information à côté explique pourquoi.
Ce qui ne sort jamais
Un catalogue ne contient que des comptages agrégés. Aucune ligne patient, aucun identifiant, aucune date d’événement individuelle — et, pour une cellule masquée, pas même un comptage, dans aucun fichier.
C’est la même logique que pour les bases : ce qui part de l’établissement décrit les données sans les emporter.
Pour aller plus loin
- Construire et publier un catalogue — de la configuration à la page publiée.
- Anonymiser un catalogue — seuil, masquage secondaire, perturbation et audit, avant toute publication.
- Schémas — indispensable pour que le calcul sache quoi compter.
- Cohortes — pour des effectifs exacts sur une question précise.
- Catalogue communautaire — l’autre catalogue, celui des entités publiées.